Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
NdnP25233 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nap1l2-201ENSMUST00000121720 2465 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
NdnP25233 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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