Protein–RNA interactions for Protein: P23440

Pde6b, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit beta, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6bP23440 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pde6bP23440 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pde6bP23440 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pde6bP23440 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Pde6bP23440 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pde6bP23440 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pde6bP23440 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pde6bP23440 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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