Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Myo5bP21271 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms