Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
TP20293 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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TP20293 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
TP20293 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TP20293 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TP20293 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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TP20293 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
TP20293 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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