Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
P20040 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
P20040 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
P20040 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
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