Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
P18532 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
P18532 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
P18532 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms