Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tbata-209ENSMUST00000148181 1017 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm37965-201ENSMUST00000195304 1362 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Hoxb1P17919 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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