Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Vpreb2P13373 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 159.3 ms