Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Vpreb1P13372 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms