Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP11369 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP11369 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP11369 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP11369 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PolP11369 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PolP11369 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PolP11369 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms