Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
P10404 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
P10404 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
P10404 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
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