Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
LtaP09225 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
LtaP09225 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
LtaP09225 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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