Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Hoxa5P09021 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 276.4 ms