Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Spta1P08032 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Spta1P08032 1700020A23Rik-203ENSMUST00000189961 541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
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