Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
P04212 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
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P04212 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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P04212 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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P04212 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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P04212 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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P04212 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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P04212 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
P04212 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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P04212 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
P04212 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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