Protein–RNA interactions for Protein: P03953

Cfd, Complement factor D, mousemouse

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CfdP03953 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CfdP03953 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CfdP03953 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CfdP03953 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
CfdP03953 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
CfdP03953 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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