Protein–RNA interactions for Protein: P01852

T-cell receptor beta-1 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01852 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01852 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01852 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
P01852 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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