Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ifnb1P01575 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ifnb1P01575 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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