Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
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CcnkO88874 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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CcnkO88874 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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CcnkO88874 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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CcnkO88874 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
CcnkO88874 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
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