Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cfdp1O88271 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cfdp1O88271 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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