Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Rdh16O54909 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms