Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

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Length 273 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Psmb10O35955 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Psmb10O35955 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms