Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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FxnO35943 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
FxnO35943 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FxnO35943 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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FxnO35943 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FxnO35943 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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