Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Sp100O35892 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Sp100O35892 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Sp100O35892 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Sp100O35892 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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