Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Clk2O35491 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Clk2O35491 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Clk2O35491 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
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Clk2O35491 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
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Clk2O35491 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Clk2O35491 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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