Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
H2-Q1O19441 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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H2-Q1O19441 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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