Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Casq1O09165 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
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Casq1O09165 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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Casq1O09165 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Casq1O09165 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Casq1O09165 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Casq1O09165 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Casq1O09165 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Casq1O09165 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casq1O09165 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Casq1O09165 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Casq1O09165 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Casq1O09165 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Casq1O09165 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Casq1O09165 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms