Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Sema3aO08665 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Sema3aO08665 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms