Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Gm21310J3QQ23 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms