Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Nf1-202ENSMUST00000108251 9217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm5849J3QPE5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm5849J3QPE5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
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