Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc180J3QNE4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc180J3QNE4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms