Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm3415J3QMS8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm3415J3QMS8 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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