Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Gm21863J3KMP8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms