Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20828J3KMI7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20828J3KMI7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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