Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
AK157302I3ITR1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms