Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
XntrpcF8VQM8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
XntrpcF8VQM8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms