Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Gm28048F7BCN0 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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