Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ccdc71lE9Q4T4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Ccdc71lE9Q4T4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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