Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ccl27a-204ENSMUST00000108035 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm25545-201ENSMUST00000122673 323 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm3675-201ENSMUST00000175904 1653 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 4930532M18Rik-201ENSMUST00000187189 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 AC160114.3-201ENSMUST00000222256 560 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Scgb1b27-201ENSMUST00000085618 493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 AC159196.3-201ENSMUST00000224307 1841 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm3250E9Q1M3 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms