Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm20425E9Q035 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm20425E9Q035 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms