Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Trappc8E9PWG2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms