Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syde2E9PUP1 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syde2E9PUP1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms