Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Vpreb3D3Z6J4 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms