Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
BC048679D3YXE9 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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BC048679D3YXE9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
BC048679D3YXE9 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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