Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tmf1B9EKI3 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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