Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms