Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PtprsB0V2N1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms