Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Ttll11A4Q9F4 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ttll11A4Q9F4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.1 ms