Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Atp8b5A3FIN4 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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Atp8b5A3FIN4 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atp8b5A3FIN4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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