Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Samt1A2BED8 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Samt1A2BED8 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
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